開業以来47年の変遷を経てまいりました。
平成11年に病院施設の全面的な増改築工事を行って、その名称を諫早記念病院と改名、
外来部門を拡充・強化し、一般病棟85床の内50%を個室化しました。
加えて28床の完全型療養型病床群の設置を行い、リハビリテーション施設の拡充、デイケア部門の新設など全面的な刷新を実施しました。
現代は心臓病、癌、脳卒中などが増える一方、高齢社会の到来と共に在宅医療、リハビリテーションやデイ・ケア等、幅広い医療サービスが求められております。
地域の各医療機関及び福祉施設とのネットワークによる保健・医療・福祉の総合的医療サービスの充実が必要です。
また、生活習慣病の予防・早期発見の為、先進の医療機器の整備と共にスタッフの能力強化を図り、今後も地域の皆様の医療ニーズに応えてまいります。

リハビリテーション専門病院として早期の社会復帰支援を目指しています。8割が脳疾患、脊髄損傷等の神経疾患であるため、早期リハビリテーションを行う体制を充実させています。また経管栄養の方には経口での食事摂取ができるようリハビリテーションを行っており、評価方法として嚥下造影検査法を取り入れている。
理学療法士、作業療法士、言語聴覚療法士、心理士を含め100名以上が在籍しておりセラピストのマンパワーも充実しています。

人間ドックや脳ドック、各種健診に特化しているのが特徴です。生化学分析センターを併設し、素早く検査結果が分かるため、患者さんに好評。

2000年5月、国内でも最高峰の心臓病治療センターとして開院しました。
平成12年5月に高度先進心臓病治療センターとして神奈川県の葉山町に開院。
60床の病室（うちICU6床）完備。
MRI、64列マルチスライスCT、核医学検査（RI）、超音波検査等の高性能診断装置を備え、手術室を2室、心臓血管カテーテル検査室を1室使用し、毎日心臓手術およびカテーテル検査・治療を実施しています。

治療の特色として、動脈グラフトを用いた冠動脈バイパス術、体外循環を使用しない心拍動下冠動脈バイパス術（off pump CABG）、重症心不全を伴う心筋症に対する左室形成術（Dor手術、Batista手術、SAVE手術）、僧房弁形成術、大動脈弁形成術および心血管カテーテル治療（Ballon、STENT）などを実施。
最近では内視鏡やロボットを使用した心臓手術の研究も進めています。

年間の心臓手術件数は、350から400例で、冠動脈バイパス手術は200から250例で手術死亡率は、約1％、弁膜症手術は年間100例で手術死亡率は約2から3％で心房細動に対するmaze手術も積極的に行っています。
心臓領域以外の特色として子宮筋腫に対するカテーテル治療（UAE）センターを併設し、積極的に取り組んでいます。